Die große Orgel wurde mehrmals umgebaut und erweitert, so auch 1930 - 1932. Seit dieser Zeit trägt sie den Namen "Brucknerorgel" im Andenken an den großen Symphoniker Anton Bruckner (1824 - 1896), der gewissermaßen als Florianer Sängerknabe seine musikalische Laufbahn begann. Auch als Bruckner im Alter von dreißig Jahren die Stelle des Linzer Domorganisten antrat, blieb er dem Stift eng verbunden, genauso wie nach seiner späteren Berufung zum Professor und Hoforganist nach Wien.