Der Hauptort Niederwinkling liegt ca. 1,5 Kilometer von der Autobahnanschlußstelle Schwarzach/Niederwinkling entfernt.
Die Gemeinde Niederwinkling wird von zwei wichtigen überörtlichen Wanderwegen durchkreuzt, und zwar entlang der Donau vom Fernradweg "Deutsche Donau" von Regensburg nach Passau/Wien und vom grenzüberschreitenden Wanderweg "Der Baierweg" von der Donau in Richtung Böhmen.