Dieser wichtige Sammlungskomplex wurde ab Beginn des 18.Jh. zusammengetragen.

Dank der Auflösung von religiösen Einrichtungen und privaten Schenkungen zählt die Bildergalerie ungefähr 3000 Gemälde und bietet einen Überblick über die Malerei im Veneto von Beginn des 14.Jh. bis zum 20.Jh. Unter anderem befinden sich hier Bilder von Giotto, Lorenzo Veneziano, Squarcione, Bellini, Giorgione, Tiziano, Romanino, Bassano, Veronese, Tintoretto, Piazzetta und Tiepolo.

Interessant ist auch die kleine aber bedeutende Sammlung von Gemälden von ausländischen Künstlern, hautsächlich von flämischen und holländischen Malern des späten 15. - 18.Jh. Die Bildergalerie Emo Capodilista umfasst eine Sammlung von 543 Gemälden, die dem Museum 1865 von Emo Capodilista vermacht wurden. Diese Sammlung zählt zahlreiche historisch-feierliche Porträts, die die einzelnen Mitglieder der Familie oder berühmte Persönlichkeiten darstellen, mit denen die Familie Umgang pflegte.

Die Grabsteinsammlung umfasst architektonisch-dekorative Fragmente, die aus Padua und Umgebung stammen.
Sehenswürdig ist die Skulpturensammlung mit Werken von Bildhauern wie Briosco und Canova vom 14.-20.Jh.

Der Bereich mit den Renaissance Bronzestatuetten zeugt von einer Kunstform, die in Padua zwischen dem 15. und 16Jh. besonders blühte.
Die Abteilung für angewandte Kunst ist besonders reichhaltig: Keramiken, Juwelen, Schmuck, Stoffe, Möbel, Elfenbein.